たんぽぽ教会は、1999年 9月 5日、前身の府中南伝道所（1997年 2月開設）から発展する形で設立されました。2002年に現在の場所（府中市分梅町3丁目）に教会堂を献堂。
2015年4月。たんぽぽ教会の創設に従事した相山扶牧師の後任として、原雅幸牧師が就任しました。2015年度は、2人の牧師による共同牧会が行われています。